Die Organe des Region Köln/Bonn e.V. sind die Mitgliederversammlung und der Vorstand. Zusammensetzung, Aufgaben und Befugnisse regelt die Satzung.
Die Mitglieder der Mitgliederversammlung setzen sich aus 93 Vertreterinnen und Vertreter der Mitglieder zusammen.
- Landrat Jochen Hagt (Oberbergischer Kreis) - Vorsitzender
- Landrat Stephan Santelmann (Rheinisch-Bergischer Kreis) - stellv. Vorsitzender
- Hauptgeschäftsführer Ulf Reichardt (Industrie- und Handelskammer zu Köln) - stellv. Vorsitzender
- Geschäftsführendes Vorstandsmitglied Dr. Reimar Molitor (Region Köln/Bonn e.V.)
- Oberbürgermeisterin Henriette Reker (Stadt Köln)
- Oberbürgermeister Uwe Richrath (Stadt Leverkusen)
- Oberbürgermeister Ashok Sridharan (Bundesstadt Bonn)
- Landrat Sebastian Schuster (Rhein-Sieg-Kreis)
- Landrat Michael Kreuzberg (Rhein-Erft-Kreis)
- Landrat Hans-Jürgen Petrauschke (Rhein-Kreis Neuss)
- Vorstandsvorsitzender Alexander Wüerst (Kreissparkasse Köln)
- Vorstandsvorsitzender Artur Grzesiek (Sparkasse Köln/Bonn)
- Vorstandsvorsitzender Rainer Schwarz (Sparkasse Leverkusen)
- Hauptgeschäftsführer Dr. Hubertus Hille (Industrie- und Handelskammer Bonn/Rhein-Sieg)
- Hauptgeschäftsführer Dr. Ortwin Weltrich (Handwerkskammer zu Köln)
- LVR-Direktorin Ulrike Lubek (Landschaftsverband Rheinland)
- Vorsitzender Andreas Kossiski (MdL) (DGB-Region Köln-Bonn)
- Rainer Deppe (MdL) (Vertreter der Mitgliederversammlung)
Gäste im Vorstand:
- Regierungspräsidentin Gisela Walsken (Bezirksregierung Köln)
- Landrat Dr. Jürgen Pföhler (Kreis Ahrweiler)
- Landrat Günter Rosenke (Kreis Euskirchen)
